在通州区的专科院校包括：
北京工业大学通州分校：
位于通州区，提供多种专业教育。
北京物资学院：
在物资学院物流管理专业方面享有盛誉，是专科教育中的佼佼者。
北京财贸职业学院：
财经类院校，是国家示范性高等职业院校之一，提供多个专业。
北京电子科技职业学院：
位于北京经济技术开发区，是北京职教园区所在地。
北京社会管理职业学院：
位于通州区，提供社会管理相关的专业教育。
北京黄埔大学：
提供多种教育课程，包括专科教育。
北京市交通管理干部学院：
专注于交通管理方面的专业教育。
北京市教育学院通州区分院：
提供教育相关的专业课程。
北京现代音乐学院：
专注于音乐教育。
北京交通运输职业学院：
提供交通运输相关的专业教育。
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